直接回答：深圳自然人独资有限公司仍是独立法人，股东通常以认缴出资额为限承担责任；但只有一个股东的公司，股东若不能证明公司财产独立于个人财产，应对公司债务承担连带责任。证明重点不在一张声明，而在公司账户、账簿、合同、发票、资产和个人消费长期分开且能相互印证。
法律把举证压力放在单一股东一侧
《中华人民共和国公司法》第二十三条明确了单一股东不能证明财产独立时的连带责任，第三条同时确认公司以全部法人财产承担债务。可在中国政府网公司法全文核对。发生债务争议后，股东仅说“公司是有限责任”通常不足以完成证明。
四类混同最容易留下风险
常见问题包括客户款长期收进个人账户、公司替股东支付家庭消费、股东无依据频繁取款、公司资产登记在个人名下。股东垫款或向公司借款并非一律禁止，但应有用途、审批、合同和回款记录，不能把资本投入、报销、分红和借款混在同一笔流水里。
从成立首日建立独立证据
- 开立并实际使用公司银行账户。
- 以公司名义签约、收款、开票和购买资产。
- 股东垫款、借款、报销分别制作凭证。
- 按期形成账簿、财务报表和纳税资料。
- 重大关联交易履行内部决策并保留定价依据。
设立阶段需要把出资、账户和章程安排一次理顺，可参考深圳公司注册服务说明准备基础文件。
独资公司也要保留书面决定
公司法第六十条规定，只有一个股东的有限责任公司不设股东会，股东作出法定事项决定时应采用书面形式，并签名或盖章后置备于公司。利润分配、重大投资、借款和资产处置留有书面决定，能让账务处理和资金用途形成对应关系。
常见问题
个人账户代收一次货款就一定构成混同吗？
不能仅凭单笔交易下结论，但应及时归还公司、准确入账并保留原因和流向证据。
股东垫付注册费用可以报销吗？
可以按真实用途和有效凭证处理，报销金额、批准记录及收款人应清楚，不宜用整数转账替代明细。
每年出一份审计报告就一定免责吗？
审计材料可能是证据之一，但不能替代日常账户、合同和账簿的一致性，也不当然排除法院对混同事实的判断。
审慎提示：已有个人代收、公私互付或资产混用时，应先按真实交易复原记录，不得倒签或虚构凭证。
资料参考
政策和办理口径可能调整，提交前请以主管部门最新公开要求为准。